L'Autorità di gestione e il Comitato di sorveglianza del PSR monitorano la qualità dell'attuazione del Programma nonché lo stato di attuazione mediante indicatori finanziari, di prodotto, di risultato e di impatto. L'andamento, l'efficienza e l'efficacia del PSR rispetto ai suoi obiettivi sono misurati in base al set di indicatori previsti dalla Commissione europea ne Quadro Comune di Monitoraggio e Valutazione (QCMV) che permettono di analizzare e valutare la situazione di partenza nonché l'esecuzione finanziaria, i prodotti, i risultati e l'impatto . Sulla base di tali indicatori, l'Autorità di Gestione del Programma si è dotata un sistema di monitoraggio che consente di misurare l'avanzamento del programma sia da un punto di vista della realizzazione (sulla base della quantificazione degli indicatori di prodotto e di risultato) che finanziario e procedurale. La sintesi di tale attività è riportata annualmente nelle Relazioni annuali sottoposte ad approvazione al Comitato di Sorveglianza.